《爭分奪秒》講述2004年4月1日，西九龍重案重組沙展馮志偉，臥底探員楊啟東、刑事情報(bào)科(CIB)高級督察黃家輝，三個(gè)本來各不相干的人，于4月1日開始至4月30日內(nèi)，要搗破香港最大的黑幫集團(tuán)，更要阻止一項(xiàng)暗殺候任警務(wù)處處長王振揚(yáng)的大陰謀。三人就在這三十日內(nèi)，將香港作為一個(gè)困獸斗的大舞臺，用最接近事實(shí)的角度，與匪幫作最斗智斗力的競賽，演繹一個(gè)爭分奪秒的三十集警察故事。香港副警務(wù)處長王振揚(yáng)一向疾惡如仇，有消息傳出揚(yáng)將會(huì)接任成為新一任的警務(wù)處長，振揚(yáng)的上任雖令匪徒聞風(fēng)喪膽，但亦傳出職業(yè)殺手已接到命令要置振揚(yáng)于死地。警方覺事態(tài)嚴(yán)重，派出情報(bào)科A隊(duì)高級督察黃家輝全力保護(hù)振揚(yáng)，并令家輝查出幕后黑手的真正身份。家輝經(jīng)過詳細(xì)分析后認(rèn)定是香港最大黑幫家族侯家所為。侯家話事人侯文華更膽大妄為，誓言要在4月30日之前，將香港的黑道撥亂反正，將白道陷于恐慌之中。　　文華前往泰國與泰國新崛起黑幫頭目Sam商量合作大計(jì)，港泰兩地黑幫意欲結(jié)盟，將整個(gè)東南亞的毒品市場壟斷，兩地黑幫結(jié)盟后勢力必更大。此舉引起了泰國警方的注意，派遣女刑警Rita，接手處理調(diào)查。Rita調(diào)查Sam，發(fā)覺原來Sam只是一個(gè)幌子，真正操控黑幫的人竟是泰國華僑富商鄭坤，亦是鄭坤在幕后一手策劃整個(gè)行動(dòng)。　　志偉在酒吧認(rèn)識一名女子彭慧，彭慧更對志偉情有獨(dú)中，但志偉知悉彭慧原來是文華最深愛女人后，即多番逃避，不過彭慧仍是苦纏不休。文華得悉情敵出現(xiàn)，遂因利乘便插贓嫁禍，令志偉蒙上不白之冤。志偉因殺警之嫌被通緝，心知自己被警察部內(nèi)奸插贓嫁禍，志偉找家輝幫忙，希望借助情報(bào)科搜集出證據(jù)查出內(nèi)奸的真正身份。　　家輝從Rita方面得知耀國早派出臥底滲入侯家搜集罪證，于是決定接手調(diào)查，并希望臥底能助自己一臂之力。　　一波未平一波又起，志偉雖替自己找出辯護(hù)證據(jù)，但愛女馮美茵卻遭文華囚禁，要挾志偉燒毀重案組證物房，偷取一份三十年前的證供。過程中，志偉卻發(fā)現(xiàn)這一份重要資料，揭示文華與三十年前香港一名大毒梟陳萬豪似有著一段不尋常的關(guān)系。　　志偉與文華終弄至勢不兩立地步，加上壓力越大反抗越大，志偉與彭慧經(jīng)過風(fēng)風(fēng)雨雨，感情反而更趨真摯牢固，一段三角感情令這場正邪對壘更形激烈兇險(xiǎn)。振揚(yáng)康復(fù)后準(zhǔn)備上任之際，卻傳來丑聞，指振揚(yáng)當(dāng)年涉及一宗受賄枉法案，此事引來極大回響，振揚(yáng)也有被拉下馬來之虞。　　萬豪重臨香江，誓要建立一個(gè)前所未有的跨國黑社會(huì)王國，誓要香港黑白兩道低頭。面對這個(gè)龐大的陰謀，志偉能否對付文華，與彭慧又能否跨過重重困難，終成眷屬？啟東為救Rita而燃起愛火，詠琪會(huì)否因愛成恨，置其于死地？家輝在僅余的有生之日，能否破「謀殺準(zhǔn)一哥」案，與志偉撥亂反正，成功瓦解萬豪與文華的陰謀，剿滅這國夸國的黑社會(huì)王國？